近日，中山大學有害生物控制與資源利用國家重點實驗室曹永長教授團隊發(fā)現(xiàn)了一種能夠引起仔豬腹瀉，對新生仔豬具有高致死性，對生產(chǎn)造成嚴重危害的新的冠狀病毒。相關研究成果于2017年6月27日以“A New Bat-HKU2–like Coronavirus in Swine, China, 2017”為題在國際傳染病領域權威期刊《新發(fā)傳染病》(Emerging Infectious Diseases)上在線發(fā)表。
2010年入冬以來，豬流行性腹瀉病毒(PEDV)變異株開始在我國流行，并導致全國范圍內(nèi)的嚴重爆發(fā)，初生仔豬感染后死亡率達90%以上; 隨后，可導致仔豬腹瀉的新型腸道冠狀病毒Delta冠狀病毒(PDCoV)也被發(fā)現(xiàn)；冠狀病毒的高變異特性目前已經(jīng)成為仔豬腹瀉防控的難點，給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大經(jīng)濟損失，對養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展形成嚴重威脅。
2017年初開始，廣東部分豬場先后暴發(fā)免疫豬群新生仔豬腹瀉、死亡的案例，臨床發(fā)病比PEDV稍晚、死亡率稍低，實驗室檢測排除了常見的幾種豬腹瀉相關病毒感染。為快速診斷該疫情的確切病原，曹永長教授團隊利用高通量測序技術對死亡仔豬小腸內(nèi)容物進行檢測，發(fā)現(xiàn)了一種新的冠狀病毒，將其命名為豬腸道α冠狀病毒(porcine enteric alphacoronavirus, PEAV)。全基因組序列分析顯示PEAV與來源于蝙蝠的HKU2同源性高達95%，其中纖突蛋白的差異性較大。兩種病毒的纖突蛋白核苷酸和氨基酸相似性分別只有80%和87%，這很可能是PEAV能夠在豬群中傳播的關鍵。通過比較7個保守的關鍵復制酶的氨基酸序列相似性，確定PEAV與HKU2在病毒學分類中屬于同一種病毒。
中山大學生命科學學院博士生龔浪和博士后李杰為論文的共同第一作者，廣東溫氏食品集團股份有限公司溫志芬高級畜牧師和中山大學曹永長教授為論文共同通訊作者。該研究得到了國家重點研發(fā)計劃的支持。
原文摘要：
We identified from suckling piglets with diarrhea in China a new bat-HKU2–like porcine coronavirus (porcine enteric alphacoronavirus). The GDS04 strain of this coronavirus shares high aa identities (>90%) with the reported bat-HKU2 strains in Coronaviridae-wide conserved domains, suggesting that the GDS04 strain belongs to the same species as HKU2
